冗员及三殿叙功的浮滥，由此裁去加秩和寄俸200余人，为国家节省一笔库财。他又上疏揭发李鲁生、霍维华原是魏党成员，伪装清白，妄图在清理魏党中蒙混过关。经过多人相继弹劾，李鲁生被撤职，霍维华被停职查办。

    同年，颜继祖还为大学士刘鸿训被魏党余孽反诬而申辩。刘鸿训曾出使朝鲜，乘海船归国，沿途收容难民，超载船沉。鸿训漂泊3日夜，只身生还。天启六年(1626年)冬因反对魏忠贤，被削职为民；到崇祯元年魏党倒台时起用为礼部尚书兼东阁大学士。上任后即揭发魏党李维垣、李恒发等11人，人心大快。但魏党余孽、御史袁弘勋串同锦衣卫张道濬，反诬刘鸿训早先出使朝鲜时贪污渎职，“满载貂参而归。”刘鸿训一时处于劣势，幸得继祖仗义执言，指斥袁弘勋混淆是非、张道濬越权乱政，都要严办。崇祯帝遂将袁弘勋撤职查办，提升继祖为工科右给事中。

    在去的路上，崇祯皇帝朱由检犹豫了很久，才将刘鸿训和颜继祖都招到了龙辇上，将自己对郑芝龙的意图跟两个人说了。

    颜继祖听说皇帝想让郑芝龙帮着运军队和百姓到朝鲜去，也感觉非常的棘手，如果光是运送百姓，这还容易一些，运送军队的话，确实是有些敏感了。

  
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