岛南端的久春古丹袭击了松前藩藩主的税务所，焚烧仓库，并宣布库页岛为沙皇俄国所有。俄日之间开始为库页岛的归属发生武装冲突。

    1807年，江户幕府派远山景晋赶赴库页岛，将库页岛的管辖权收归幕府，又命令仙台、会津两藩派兵驻守库页岛。

    1808年，江户幕府发布“俄船驱逐令”，指令沿海各地，“今后无论在何处海面发现俄船，应即严加驱逐，如敢靠岸，应迅即逮捕或处死”。同年，江户幕府相继派遣最上德内、松田传十郎、间宫林藏到库页岛勘察，初步得出库页岛是一个岛屿的结论。

    1808年，日本的江户幕府相继派遣最上德内、松田传十郎、间宫林藏到此。松田传十郎在库页岛最西端（北纬52度）建立“大日本国国境”标柱。

    1809年，间宫林藏再次对库页岛进行勘察，并沿黑龙江溯流而上，访问了清政府设在黑龙江下游德楞的地方政府。由此，日本人第一次确切地得知库页岛是一个岛屿。正式定名为“北虾夷”。此时，库页岛上的阿伊努人已经被纳入日本人范围，自此库页岛南部基本上处于日本控制之下。

    1814年，江户幕府从库页岛撤兵，并恢复了松前藩对库页岛的管辖权。

   
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