曼沿袭了前传相同的世界观，故事发生在距奈克斯特不远的未来，大概也就是五年后的世界，当时的人类所了解的世界看上去并没有发生太大的变化，但是世界各地不断有“异生兽”作乱的报告。为了暗中解决这个问题，成立了世界性的防卫组织，它的日本支部被称为。而的下属组织就是夜袭队r。他们的任务就是秘密消灭异生兽。但是，巨型异生兽突然出现在拥有骄人战绩的夜袭队面前，他们陷入了苦战。这时，光之巨人奈克瑟斯奥特曼随之登场。

    奈克瑟斯完全不同于其余的奥特曼世界，其想要传达的主题更加深邃，贯穿全剧的是一种悲伤昏暗的气息。最为特色的，就是适能者的不断转变，如果自己进入奈克瑟斯的世界中，说不定会同样具有变身成为奈克瑟斯的资格。毕竟奈克瑟斯完全就是奈克斯特离开后，遗留的光进化之后的存在，而哲也本就是奈克斯特的适能者，那么具有相同基因属性的他，必定是能够接纳奈克瑟斯的光！

    五年的时间，说长不长，说短却也不断，但是哲也相信，水原沙罗一定会等待着自己的，等着自己归来的时刻！

    顿了顿，哲也脸上露出了古怪的表情，语气有些不悦的问道：“系统你刚刚的答话是耍我的吧分明挖了一个坑让我往下跳。”
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