已经被战争吓破胆的清廷反复权衡，最终决心放弃台湾。5月20日，下令“署台湾巡抚布政使唐景崧，著即开缺来京陛见；其台省大小文武官员，并著饬令陆续内渡。”而李鸿章也专门向伊藤博文拍了电报，称“日本自应派遣水陆各军，以资弹压，保持平安。”

    清政府已经决定放弃台湾，但台湾的官绅百姓却不甘心就此成为日本人的顺民，但今后该何去何从，上到名为最高军政长官的唐景崧，下至普通百姓，其实每个人的心里都没有什么底，也不知该如何处置。

    唐景崧现在也是进退两难，布政使顾肇熙和台湾兵备道陈文騄已经借机逃回大陆，二、三把手的出逃更弄得岛内人心惶惶，大批官员也开始纷纷出逃。但他走不了，朝廷让他守在台湾办理交接，但这可能么？

    而两江总督张之洞却给他拍了封电报，让他尽力守住台湾两、三个月，哪怕手中有一府一城之地，就能引起列强出兵干涉，最终日本人不得不放弃台湾。而且法国人也表示愿意租借台湾之地，又让他心底燃起一丝希望。

    经过一番商议，陈季同向唐景崧提出拯救台湾的新计划：仿照西方惯例，宣布台湾自主，成立一个临时抗日政权，由义军和和守台清军联合作战，领导台湾军民抗日保台。
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