万历末年以来，由于皇帝本人的怠政，作为南方漕粮运输的惟一主干通道，京杭大运河在淮北和山东段，经常发生淤塞，动辄难于通行。

    有的时侯，一断就是几个月之久，而运河两岸的州府县官们，在运河畅通的时候，喜欢打着朝廷的旗号设卡收费得利，而当运河淤塞的时候却总是袖手旁观，将清淤的责任一股脑儿地推给朝廷，一点养护维修的责任都不负。

    这样的事情绝不能再继续下去。

    朝廷既然设立了漕运总督衙门，那么对于运河的管理，以及沿着运河两岸与运河相关的事务管理，就应该全部收归给漕运总督衙门，绝不能再政出多门，让人无所适从了。

    比如，明朝运河上的钞关，除了七大钞关是户部设立的以外，还有许许多多大大小小多如牛毛的税关，都是皇帝的内廷或者沿河的督、抚、总兵、州府县官，甚至是土豪劣绅们设立的。

    这些朝廷户部的、地方官府的，甚至是官设私营的钞关税卡，使得整个运河上的各种税费多如牛毛，一来搞得民怨沸腾不说，二来这些收来的税银或者实物税，十成里的七八成，都进了太监或者地方各级官僚税吏的腰包，户部的税关能够收到的税银或者实物，只占其中的两三成而已。

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