藏医学逐步形成了自己独特的理论体系。其历史之悠久，内容之丰富、系统是仅次于汉族医学的一个完整的医学体系。藏医理论认为，人体内存在三大因素，“龙”、“赤巴”、“培根”；七大物质基础，即饮食精微、血、肉、脂肪、骨、骨髓、精；三种排泄物，即小便、大便、汗。三大因素支配着七大物质基础及三种排泄物的运动变化。在正常生理条件下，上述三者互相依存、互相制约，保持着相互协调和平衡，当三者中的任何一个因素或几个因素由于某种原因而出现过于兴盛或衰微的情况时，则变成了病理性的东西。藏医认为，七大物质中，以饮食精微最重要，其它物质均由它转化而来。血能维持生命；肉似围墙，保护身体；骨为支架，构成躯体；骨髓生精；精能生殖繁衍；脂肪荣润肤色。人体内的器官，藏医认为也有五脏六腑。五脏指心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏，六腑指大肠、小肠、胃、膀胱、胆和三姆休。对于各脏器的生理功能，古代藏医用生活中的各种活动和所需的用品来作比喻。如：心脏－－－国王，端坐在宝座上，居人体胸腔的正中；肺脏－－－犹如大臣和太子，围绕着君王；肝脏和脾脏－－－似君王的大、小后、妃，远处在君王下端，介关系又很密切；肾脏－－－像一座房屋的脊梁，没有它，身
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