光是一种奇怪的能量，它无所不在，但一旦碰到其他物质，就会消失的无影无踪。因为绝大多数物质都会吸收光子。

    当分子或者原子吸收光子的时候，爱因斯坦.哪都有你发现，活化的分子或者原子数等于吸收的光量子数，这个道理看起来似乎很简单，但是在当年光的波动学说拥有垄断地位的时候，提出这样的理论需要非常大的勇气。

    当分子吸收一个特定能量的光量子之后，分子将由于吸收了光子的能量，改变自己的量子态，大部分情况下，这种改变是不稳定的，但是如果这种量子态跟其它分子/原子之间形成某种类似共价键的锁链，这种改变就会变成稳定的，事实上，这就是两个分子进行光组装的基本原理了。

    电组装和磁组装的作用也是类似的，特定的电压或者磁场同样可以改变分子的量子态，促使分子和分子之间形成牢固的锁链，从而制造出需要的介观结构来。

    当然，由于光量子能量相对于电场和磁场更加容易确定，所以光化学在分子机器中的作用要远远大于电磁化学。

    在哥德尔系统升级之后，分子机器，首先是分子组装的项目也取得了巨大的进展，哥德尔系统给出了一个配方和步骤的最佳方案，方案大概是这个样
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