毛文龙案之所以会反复还在于一个很有问题的观点，那就是认为袁崇焕斩帅造成了东江的无主状态，之后相继发生内乱，最后孔有德、耿仲明、尚可喜陆续降清，为侵明效力；而且毛文龙能牵制后金不能西向，斩帅使后金从此得以毫无顾忌地长驱深入，己巳之变便是明证。
    建立在这两个论据的基础上，自然会得出袁崇焕斩帅不利于辽东战局的结论。
    这两个责难是江浙文人理直气壮袒护毛文龙的依据，同时也是后人质疑斩帅的立足点。
    直至今仍有不少人称袁崇焕斩帅“不仅大大削弱了抗敌力量，而且对辽东战局乃至对他本人都产生了极为不利的影响”，主要表现在“文龙死后，皮岛无主，各支队伍互相攻杀，己不能对后金起牵制作用”，“东江内乱，后金彻底解除了后顾之忧，便集中精力对付宁锦一线”。
    这种观点是值得商榷的。
    前文提到，斩帅之后，袁崇焕重用刘兴祚兄弟，让其掌管东江军镇的大权，镇中精锐皆由其掌握。
    当时军镇中有两种势力，一种是毛文龙旧部，一种是刘兴祚兄弟，他们之间既有合作也有矛盾，袁崇焕一方面两种势力参用，另一方面又借刘氏兄弟压制毛文龙旧部。
    斩帅后，袁崇
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