这些政策的目的是要改造旧日本，推动工业化发展。在用新制度替代旧制度，就一定会遭到旧制度既得利益者的反对。废藩置县后，旧有的社会主流体系被彻底摧毁。新制度下面的所有官员都是通过国家控制的教育和考试体系层层选拔出来的。在这个方面，大久保利通等人完全照搬了中国的公务员制度。这个制度的威力很容易就显露出来，相同的选拔标准，相同的公务员考试题目。大量支持中央集权的人员成为了公务员预备军。

    士族利益代表者西乡隆盛等人搞出了“征韩论”，经过御前会议讨论之后遭到了天皇正式否定。西乡等征韩五参议愤然辞职，大批持士族立场的官员和近卫军军官也随之辞职。支持中央集权的公务员们轻松接掌了明治政府的各级官职。

    到了此时，双方的矛盾已经接近不可调和的阶段。讨伐虾夷共和国的军事行动算是最后妥协的可能。在6月，发现战局不利的大久保利通就要求士族军队暂时撤出北海道。士族军队拒绝了大久保利通的建议，继续在北海道坚持作战。等战局到了无法挽回的时候，士族们就要求政府军出动，来扭转乾坤。

    木户孝允承受了极大的压力，可他也没办法。虾夷共和国的海军中聚集了日本相当优秀的一批海军指挥官，
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