当秦都由栎阳迁至咸阳之后。公孙鞅便开始制定一系列新法令，实行第二步变法改革。首先，在秦国全面推行县制。将所有的各自独立的乡、邑、村落合并为县，统一管理，国内共划分为四十一县。县设县令一人，县丞一人；后来又增设县尉一人。县令是全县的最高官吏，县丞是县令的助手，县尉掌管全县的军事事务。这样，便于将全国的军政权力皆集中于朝廷，由此，秦国建立了中央集权的统一的封建政治体制，为封建经济的发展奠定了政治基础。

    不久，公孙鞅又颁布了土地改革的法令，宣布“田开阡陌封疆”废除了约束奴隶的“井田制“，实行承认土地私有的“辕田制”，并允许土地的买卖。同时，还扩大了中央政府所拥有的土地授田制度，增加了对土地的税收，进一步促进了农业生产的发展。

    公孙鞅还颁布法令统一度量衡。传世的“商鞅方升”即当时的标准量，铜质、长方、有柄，容积为198.574立方厘米。又出土秦昭王时期的铜质禾石权，一石（129斤）重30750克，即每斤256.3克。公孙鞅所制定的亩制，《说文解字》说：“六尺为步，百步为亩。秦二百四十步为亩。”百步为亩者，为秦国旧制，二百四十步为亩，即公孙鞅所定。这对统一的赋税制
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