照秀保的设想，这批二百余人的忍着部队将拥有四个头目，也就是上忍，分别是兴国寺信风、雾隐鹿右卫门、出浦盛清以及横谷幸重，由此可知，大和忍军和其他大名的忍军不同，并没有一个统一管辖所有忍者的头领，而是将这一大权分散到四个人手中，秀保之所以这么做。除了考虑到这批忍者来路不通，互相之间尚未磨合外，更重要的还是不希望将自己最为看重的情报网，完全交付给一个人，正所谓“鸡蛋不要放在一个篮子里”，说的便是这个意思。

    为了充分发挥这些忍者的优势，而又不在内部形成所谓的派系，秀保刻意将风魔忍者、甲贺忍者、户隐忍者改名为关东忍者众、西国忍者众以及中山忍者众，并且通过定期选拔，从三部忍者众中抽调约三成的优秀忍者组建近畿忍者众。用以保卫大阪、京都、伏见以及御东山四城的安全。除此之外，秀保还破天荒地试行了“流官制度”，即每一位上忍担任所部忍者头目的时间不得超过一年，比如说，关东忍者的初代头目可以是兴国寺信风，但是这种情况最多维持一年，一年之后，就必须换由其他上忍担当头目，可以是甲贺出身的鹿右卫门。可以是甲信出身出浦盛清或者横谷幸重，但是除非秀保亲自批准，否则决不能由兴国寺连任。

    这种“
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