任了一些蒙古势力进入南疆肆意妄为，导致了明军也不断派遣人马暗自来南疆和元蒙交火，如此一来将彻底的把中原战火引到南疆来，于是引发了第一次内讧，苗一雄竟然离奇死亡，傻子都知道他是被暗杀的，他的尸体最后被发现在后山上，教主横死让百中教一下跌入低谷，那时候元、明双方对南疆都虎视眈眈，相逼甚紧，要求百中教站在自己的阵营中，失去了教主面对这种复杂局面肯定是不行的，但是谁来当这个教主也很头疼，教内数次商讨互相谁也不服谁，都没有结果，元、明双方步步紧逼，最后无奈，只好让苗一雄的女儿苗不燕继任了教主。

    苗不燕上台之后，面临复杂的形势颁布的新政第一件事就是收拾教众，让曾经为苗一雄死亡而引起混乱的五大寨和教行全部收拢，坚持祖上两不相帮的规矩，谁都不帮，并且严令元明双方“擅自踏入南疆者死”的命令，这让百中教内部紧张的形势又稍微缓和了一阵，因为中原的战火又重新远离了这里。

    明朝建立以后，元蒙彻底退出历史舞台，朱元璋让人多次来南疆招安，多次协商之下，苗不燕答应归于大明，这一举措又引起了教内的部分人的不满，他们认为排汉的举措应该坚持下去，但是苗不燕却不同意，敏锐的指出要想南疆发展的好，其
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